Skip to content

Dengda98/PickNet_package

Folders and files

NameName
Last commit message
Last commit date

Latest commit

 

History

2 Commits
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Repository files navigation

(脚本重整理)PickNet —— 基于深度卷积网络的地震波初至拾取模型


picknet程序是一系列脚本,未组织成Python安装包的形式, 故使用上会有不便,这里我做出一些修改,使之可以以Python包 的形式安装,而不再要求运行在picknet源码路径。这些调整 主要是为了方便我自定义拾取输入的数据。

下载

可以克隆库

git clone https://github.com/Dengda98/PickNet_package

由于内部将包含模型文件,使用压缩包上传。下载后运行以下命令解压

cat picknet.tar.gz.* | tar -xzv

安装方法

基本的依赖包要求详见docs/内的介绍,其中是原程序包的使用 说明。在虚拟环境中安装好依赖包后,在当前目录下运行

pip install -v .

即可在当前虚拟环境中安装picknet包。

修改部分

  • 源码文件的导入改为相对导入,并给每个子文件夹添加__init__.py 文件,使之成为一个子包;
  • 增加setup.py,其中简要地包括了必要的一些参数;
  • 增加MANIFEST.in,使得安装包的过程中能将模型文件加入安装目录
  • 将原始的说明文档放入docs/目录;
  • fcn.tester.Tester类的run函数增加raw_output选项,使得 可以选择是否保存picknet模型的原始输出,以减少存储空间占用。 【picknet运行时的内存占用问题目前没空修改,注意每次不传入大体积数据即可】

关于使用

这里保留原始的配置文件方式以及运行方式。

  • picknet配置文件
    运行以下命令可打印出picknet安装包中的参考配置文件以及 模型文件目录:

      python -m picknet.print 
    

    会输出5个路径:

    DEFAULT_P_CONFIG: [...]  # 拾取初至P波的配置文件
    DEFAULT_S_CONFIG: [...]  # 拾取初至S波的配置文件
    P_WAVE_MODEL:     [...]  # 拾取初至P波的模型目录
    S_WAVE_MODEL:     [...]  # 拾取初至S波的模型目录
    RUN_PY_SCRIPT:    [...]  # 运行`python -m picknet.run`的脚本路径
    

    故可将picknet参考配置文件复制到本地进行自定义修改,而模型文件可填入 配置文件中的save_dir关键字。

  • 运行
    原说明文档中的脚本运行方式可简单替换为

      python -m picknet.run [...]  # 后续参数设定方法不变
    
  • 自定义运行脚本
    在以上输出的路径中还包括RUN_PY_SCRIPT,故可复制该脚本到本地, 再进行修改,以自定义拾取的输入数据,当然运行的方式也变为

      python -u [自定义运行脚本] [...]  # 后续参数设定方法不变
    

Citation

Wang, J., Xiao, Z., Liu, C., Zhao, D., & Yao, Z. (2019). Deep learning for picking seismic arrival times. Journal of Geophysical Research: Solid Earth, 124, 6612– 6624. https://doi.org/10.1029/2019JB017536

About

(脚本重整理)PickNet —— 基于深度卷积网络的地震波初至拾取模型

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published

Languages